Philippe Joanin "Shasta Single Cell System"

29 avril 2025 10 h 00 min - 11 h 00 min
Philippe Joanin "Shasta Single Cell System"

Location: CBI Toulouse - Salle de conférence IBCG
169 Rue Marianne Grunberg-Manago, 31400 Toulouse

05 61 33 58 00

Comprendre le fonctionnement des organismes vivants, telle est l’ambition du Centre de biologie intégrative (CBI), à Toulouse. Pour atteindre cet objectif, le CBI développe des approches multidisciplinaires, multi-échelles des molécules isolées aux organismes entiers et aux sociétés animales, et utilise de nombreux organismes modèles, des bactéries à l'homme.

https://goo.gl/maps/Tq5uBW1EEkPrg49p7

We will present the complete Shasta solution, an end-to-end solution for single-cell omics composed of the Shasta Single Cell System, an instrument for automated single-cell omics, 2 new first-to-market single-cell omics library prep kits, and a free-to-use bioinformatics solution for data analysis.
Shasta™ Single Cell System is an automated dispensing and imaging platform for single-cell biomarker discovery with new Takara Bio high-throughput NGS library prep solutions.
• Prevalidated applications for high-throughput single-cell transcriptome & whole-genome profiling
• Intuitive user interface for setting up custom miniaturized NGS assays such as epigenomics protocols
https://www.takarabio.com/about/bioview-blog/automation/icell8-cx-single-cell-system-and-combinatorial-indexing

Shasta™ Total RNA-Seq Kit enables comprehensive profiling of the full-length transcriptomes of up to 100,000 single cells per run.
Shasta™ Whole-Genome Amplification Kit generates high-quality whole genome amplification (WGA) libraries from single cells isolated on the Shasta™ Single Cell System.

Nous présenterons le système Shasta, une solution complète pour l'analyse omique Single-Cell composée du Shasta Single Cell System, un instrument d'analyse omique , de deux nouveaux kits uniques de préparation de librairies Single-cell omiques, et d'une solution bioinformatique gratuite pour l'analyse de données.

Shasta™ Single Cell System est une plateforme automatisée de distribution et d'imagerie pour la découverte de biomarqueurs, intégrant les nouvelles solutions de préparation de librairies NGS haut débit de Takara Bio.

• Applications prévalidées pour le profilage haut débit du transcriptome cellule unique et du génome entier
     -Interface utilisateur intuitive pour programmer des applications personnalisées,      tels que les protocoles d'épigénomique. : https://www.takarabio.com/about/bioview-blog/automation/icell8-cx-single-cell-system-and-combinatorial-indexing

Le kit Shasta™ Total RNA-Seq permet le profilage complet des transcriptomes pleine longueur jusqu'à 100 000 cellules individuelles par analyse.

Le kit d'amplification du génome entier Shasta™ génère des librairies d'amplification du génome entier (WGA) de haute qualité à partir de cellules uniques isolées sur le système Shasta™.


Location: CBI Toulouse - Salle de conférence IBCG
169 Rue Marianne Grunberg-Manago, 31400 Toulouse

05 61 33 58 00

Comprendre le fonctionnement des organismes vivants, telle est l’ambition du Centre de biologie intégrative (CBI), à Toulouse. Pour atteindre cet objectif, le CBI développe des approches multidisciplinaires, multi-échelles des molécules isolées aux organismes entiers et aux sociétés animales, et utilise de nombreux organismes modèles, des bactéries à l'homme.

https://goo.gl/maps/Tq5uBW1EEkPrg49p7